Trzeci raz papież przebywał w Polsce w dniach 8 - 14 czerwca 1987 roku na II Krajowym Kongresie Eucharystycznym. Odwiedził wówczas Warszawę, Lublin, hitlerowski obóz zagłady w Majdanku, Kraków, Szczecin, Gdańsk, Gdynię, Westerplatte, Częstochowę i Łódź.
Podczas spotkania z rodakami na Zaspie w Gdańsku papież odprawił mszę w intencji ludzi pracy, wygłaszając homilię, w której uwagę skupił na wzajemnej relacji między osobą ludzką, a pracą. Przed Szczytem Jasnogórskim w Częstochowie, podczas Apelu Jasnogórskiego, Jan Paweł II prosił Matkę Jasnogórską "o zwycięską nadzieję dla swoich rodaków". W warszawskim kościele św. Krzyża podczas spotkania z przedstawicielami środowisk twórczych papież zaapelował o "wytrwałość" i aby "pomagali wytrwać innym". W czasie pobytu w Gdańsku odbyło się prywatne spotkanie Ojca Świętego z Lechem Wałęsą. Podczas tej pielgrzymki Jan Paweł II spotkał się po raz pierwszy z przedstawicielami Związku Religijnego Wyznania Mojżeszowego w Polsce. Podkreślił, że "Kościół katolicki zawsze jest blisko swych starszych braci w wierze".