Trumny z ciałami Lecha Kaczyńskiego i jego żony Marii zostaną złożone w pomieszczeniu przed kryptą pod Wieżą Srebrnych Dzwonów, w której od 1937 r. spoczywa marszałek Józef Piłsudski.
Krypta nazywana zwyczajowo kryptą Piłsudskiego jest ostatnią na trasie zwiedzania grobów królewskich w Katedrze na Wawelu. Wchodzi się do niej po opuszczeniu Krypty Wazów, przechodząc obok umieszczonej w ścianie urny z ziemią z Katynia oraz pamiątkowej tablicy wmurowanej tam w 1990 r. z okazji 50. rocznicy zbrodni katyńskiej.
W krypcie pod Wieżą Srebrnych Dzwonów znajduje się metalowa trumną z ciałem marszałka Józefa Piłsudskiego, umieszczona na kamiennym postumencie. Tuż po pogrzebie Naczelnego Wodza w 1935 r. trumna ta była złożona w krypcie św. Leonarda, ale w 1937 r. władze kościelne bez porozumienia z władzami Polski postanowiły ją przenieść.
Uczyniono to ze względu na złe warunki panujące w krypcie św. Leonarda, która była słabo wentylowana. Kard. Adam Stefan Sapieha stał się wtedy celem niewybrednych ataków, doszło do demonstracji pod Pałacem Biskupim, a ówczesny premier Felicjan Sławoj-Składkowski podał się do dymisji; zwołano nawet nadzwyczajną sesję Sejmu.
Konflikt zakończył się mediacją Stolicy Apostolskiej. W Krypcie pod Wieżą Srebrnych Dzwonów na ścianie nad trumną Piłsudskiego znajduje się wizerunek Matki Bożej Ostrobramskiej.
Poniżej jest metalowy wieniec z szablą i karabinem, umieszczony w krypcie w 1939 r. z okazji 25-lecia wymarszu I Kompanii Kadrowej oraz tablica ze słowami marszałka: "Być zwyciężonym i nie ulec to zwycięstwo, zwyciężyć i spocząć na laurach - to klęska". Po lewej stronie krypty, w narożniku, znajduje się popiersie marszałka Piłsudskiego dłuta Konstantego Laszczki z napisem "Komendantowi Orlęta".
Po prawej, w niewielkiej niszy, jest urna z ziemią z grobu matki marszałka Marii Piłsudskiej oraz tablica ufundowana przez legionistę I Brygady płk. Józefa Herzoga w 1968 r. z okazji 50-lecia odzyskania niepodległości. Matka Piłsudskiego, podobnie jak serce marszałka, spoczywa na wileńskiej Rossie.
Kryptę Piłsudskiego zamyka ażurowa żelazna krata z herbami Polski i Litwy oraz herbem rodu Piłsudskich wykonana według projektu Adolfa Szyszko-Bohusza.
Krata ta oddziela kryptę od pomieszczenia, w który umieszczono sarkofag Lecha i Marii Kaczyńskich. Jest to sala o ścianach z ciosów wapiennych z tynkowanym sklepieniem. W pomieszczeniu tym 18 czerwca - w dniu niedoszłych urodzin Lecha Kaczyńskiego - zostanie umieszczona tablica z nazwiskami wszystkich ofiar katastrofy lotniczej pod Smoleńskiem.